Diese Frage kam so oder so ähnlich schon in anderen Threads auf (z. B.
hier, es gibt aber sicher noch andere). Da es dort aber untergeht richte ich mal hier einen eigenen ein.
Wie der Name schon sagt wird in diesem Fall das System auf den Zustand zurückgesetzt mit dem es ausgeliefert wurde.
Das stimmt aber nicht ganz. Die letzten Systemupdates bleiben dabei enthalten. Das heißt System-Updates die über OTA durchgeführt wurden, manuelle System-Updates oder auch der Wechsel zwischen ShiftOS-G und ShiftOS-L (auch ein System-Update) bleiben erhalten.
Also müsste es eigentlich heißen das auf den Auslieferungszustand der zuletzt installierten Version des Betriebsystems zurückgesetzt wird.
Im Prinzip bleibt die Basisinstallation zurück und alle Daten die nicht dazugehören gehen verloren. Also installierte Apps aus Appstores, manuell installierte Apps, deren Daten und Einstellungen, alle Benutzerkonten und auch alle Systemeinstellungen. Bilder, Videos und andere auf dem Telefon abgelegten Daten gehen ebenso verloren. Das steht auch im Hinweis den man sich vor dem Zurücksetzen durchlesen sollte.
Daten die auf der SD-Karte liegen bleiben erhalten (diese müssten separat gelöscht werden falls gewünscht, evtl. wird man dazu befragt falls eine SD-Karte vorhanden ist). Allerdings bleiben sie nicht erhalten wenn man die Funktion Adoptable Storage nutzt welche für das Shift6m/5me unter Android 8 noch verfübgar ist beim Shift6mq aber bewußt deaktiviert wurde. In diesem Fall wird die SD-Karte gewissermaßen Teil des Systemspeichers und damit gehen diese Daten beim Zurücksetzen auch verloren.
Auch bleiben die Daten erhalten welche nur scheinbar auf dem Telefon liegen aber eigentlich in Cloud Diensten gespeichert sind.